Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRABDQ9H4I3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRABDQ9H4I3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms