Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MFSD1Q9H3U5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MFSD1Q9H3U5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MFSD1Q9H3U5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms