Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX5Q9H2C1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX5Q9H2C1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX5Q9H2C1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms