Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS16Q9H269 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS16Q9H269 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS16Q9H269 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms