Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLIRPQ9GZT3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLIRPQ9GZT3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms