Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPR88Q9GZN0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPR88Q9GZN0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GPR88Q9GZN0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPR88Q9GZN0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms