Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms