Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP2Q9C0B6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRINP2Q9C0B6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms