Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXQ1Q9C009 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXQ1Q9C009 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXQ1Q9C009 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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