Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1BQ9BZX4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1BQ9BZX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ROPN1BQ9BZX4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms