Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BCO2Q9BYV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BCO2Q9BYV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms