Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM54Q9BYV2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms