Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC2Q9BYS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC2Q9BYS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC2Q9BYS8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms