Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTRT3Q9BYD9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACTRT3Q9BYD9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTRT3Q9BYD9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms