Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5DQ9BY66 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5DQ9BY66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5DQ9BY66 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5DQ9BY66 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms