Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM4Q9BWF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4Q9BWF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms