Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP58Q9BVL2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms