Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2AFJQ9BTM1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2AFJQ9BTM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2AFJQ9BTM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms