Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC39A3Q9BRY0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A3Q9BRY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms