Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00467Q9BRT7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00467Q9BRT7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00467Q9BRT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms