Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYT3Q9BQG1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYT3Q9BQG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms