Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNS3Q9BQ31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNS3Q9BQ31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms