Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAPGQ9BPX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAPGQ9BPX3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAPGQ9BPX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms