Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP1Q9BPW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP1Q9BPW8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms