Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SIGMAR1Q99720 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms