Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF18Q99633 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF18Q99633 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms