Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
SCAF11Q99590 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SCAF11Q99590 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF11Q99590 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms