Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKP4Q99569 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP4Q99569 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms