Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UIMC1Q96RL1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UIMC1Q96RL1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UIMC1Q96RL1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms