Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACCSQ96QU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACCSQ96QU6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms