Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP3Q96P47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGAP3Q96P47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AGAP3Q96P47 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms