Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOPNLQ96NB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOPNLQ96NB1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOPNLQ96NB1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms