Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSNARE1Q96NA8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSNARE1Q96NA8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSNARE1Q96NA8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms