Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01600Q96MT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01600Q96MT4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms