Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNF488Q96MN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF488Q96MN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF488Q96MN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms