Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN5

TCEANC2, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANC2Q96MN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TCEANC2Q96MN5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TCEANC2Q96MN5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TCEANC2Q96MN5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms