Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CALR3Q96L12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CALR3Q96L12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CALR3Q96L12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms