Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CABS1Q96KC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CABS1Q96KC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABS1Q96KC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms