Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC35E1Q96K37 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC35E1Q96K37 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms