Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM46AQ96IP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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FAM46AQ96IP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM46AQ96IP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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