Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM5Q96DZ9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM5Q96DZ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms