Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM44Q96DX7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM44Q96DX7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM44Q96DX7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms