Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPE2Q96DL1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPE2Q96DL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms