Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GRAMD1AQ96CP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRAMD1AQ96CP6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRAMD1AQ96CP6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms