Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VPS33AQ96AX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS33AQ96AX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS33AQ96AX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms