Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1AQ96AJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VTI1AQ96AJ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1AQ96AJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms