Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC17Q96AE7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC17Q96AE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms