Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCLNQ969V3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLNQ969V3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLNQ969V3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms