Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE2E3Q969T4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE2E3Q969T4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE2E3Q969T4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms