Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM63Q969Q1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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